石器时代，约在距今7000到3300年间。其遗址和出土地点在云南有着广泛的分布，迄今共发现近400处。[8]从云南出土遗址的自然环境看，有河湖台地、湖滨地区的贝丘遗址和洞穴遗址3种人类居住选址的类型。[7]

夏商周时期

夏、商时期，云南属中国九州之一的梁州。

秦汉时期

主词条：滇国

先秦时期，云南是着名的驯马产地[9]。“昆明”人主要分布于滇西地区，而月氏系统的“叟”人则更多地分布于滇中甚至更为东部的地区。[10]云南主要有哀牢、昆明、滇等族。

前3世纪，楚国大将庄蹻进入滇池地区，建立滇国[11]。汉初时期，云南族群众多，且经济形态有农耕和游牧，发展水平不一。[12]

秦统一中国后，修“五尺道”，在云南派官“置吏”，标志着中央王朝对云南正式统治的开始。[12]

汉元封二年前109年，西汉武帝时期，开西南夷，滇王降，赐滇王王印，设益州郡，领县27个。王莽时期，南中地区发生动乱，王莽派大军十万，经过十多年的征讨，平定动乱。王莽任命文齐为益州太守。

东汉在今保山设永昌郡，亦属益州部，对云南的统治进一步深入，中国在云南西部地区的疆域已大体奠定。[13]中央王朝继续向云南移民，到东汉末年，汉族移民已在云南形成巨大势力。为控制汉族移民，边郡官员在移民中选拔和培植一批“豪族大姓”。中平元年184年黄巾起义爆发，云南大姓聚众称雄，割据一方。

魏晋时期

魏晋南北朝时期，今云南、贵州和四川西南部被称为“南中”。三国时南中部分奴隶主贵族据地自雄，诸葛亮率大军渡泸，平定南中，并调整郡县建置。

晋朝泰始七年271年，改置宁州。太康三年282年，复省入益州，置南夷校尉。太安二年303年，复置宁州。东晋咸和八年333年，李雄派李寿率兵攻占南中，李寿被封为“建宁王”，爨琛为交州刺史。咸康四年338年，分置安州。咸康五年339年，爨琛降晋，晋王朝封爨琛为宁州刺史，并承认其世袭地位，从此汉族豪族爨氏统治云南400年。[14]

汉晋时期，有较多的移民进入云南，所形成的小聚居区，主要在郡县治地与交通沿线。[15]这时云南广泛使用铁器，实行移民屯田，滇中、滇东北等地出现了新的封建生产关系的因素。

南北朝，梁大同年间，改置南宁诸州，承圣末年，云南成为西爨与东爨之地。[13]

隋唐宋时期

主词条：南诏国、大理国

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