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论文里掺了药(感谢nosokg的盟主!)
江河一笑,道:“别激动,慢慢说。”
冯野开始叽里咕噜。
“老大!我这段时间不是把国际上主流的分子动力学模拟软件,像aber和groacs全部研究了一遍嘛?我!发!现!他们的分布式计算架构有一个巨大缺陷,就是节点间的通信延迟太高,所以我重新写了一套pi调度逻辑,引入了马尔可夫状态模型(s)的概念,把蛋白质构象的连续变化轨迹切分了,就是说啊,咱们以后不需要让超算搞一条长轨迹,搞到昏头,慢嘟要死,是并行,并行概念!就是跑短轨迹,然后拼接起来……”
冯野越说越兴奋,专业词汇不断往外蹦。
江河其实是听不懂的。
但他微笑地听着,时不时嗯嗯两声,以作回应。
对于项目组成员激动汇报成果的时刻,他从来不缺乏耐心。
温柔的勒~
几分钟过后。
冯野终于说完了,道:“老大,大概就是这样!!!”
江河先夸:“真棒!”
简单的儿童心理学。
令冯野隔着电话都笑得合不拢嘴。
然后江河道:“来吧,用我听得懂的方式再说一遍。”
“哦哦哦!抱歉老大!”
冯野挠了挠头,道:“老大,简单来说,就是我把筛选和模拟的时长,缩短了至少……嗯,百分之九十?”
这其实说的都保守了。
单流程和并行流程比起来,效率根本不可同日而语。
针对不可成药靶点的高通量虚拟筛选,时间就是金钱。
缩短百分之九十,太牛逼了。
冯野是个天才。
但很快,他又说道:
“但是老大,哪怕缩短了这么多……kras蛋白表面的面积依然很大,我们要在整个蛋白表面寻找,呃,可能不存在的口袋,并且用几百万种小分子化合物去做分子对接模拟,这依然很耗时,咱要用超算一直跑,哪怕是租用【魔方】,可能也需要大半年的时间,才或许能找到一个有效的靶点?当然了,前提是真的有这个靶点存在……”
江河问:“如果我给你一个范围呢?”
“范围?”[ 本章已阅读完毕(请点击下一章继续阅读!)
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